质粒(plasmid)是细菌、酵母菌和放线菌等生物中染色体以外的DNA分子,存在于细胞质中,具有自主复制能力。质粒携带的遗传信息能赋予宿主细菌某些生物学形状,有利于细菌在特定的环境条件下生存,是细菌快速适应环境变化的重要载体。种群内的质粒运输产生的遗传变异保证了对环境变化的适应性。质粒介导的基因转移不仅在抗生素抗性基因的发现和传播中起着重要的作用,而且也在病原体的降解途径和致病性决定因素的传播中发挥着重要作用。
尽管它们很重要,技术障碍仍然限制了对质粒的研究。质粒基因组测序正在迅速成为一种标准方法,以增加我们对质粒遗传多样性和进化史的理解。它不仅可以帮助我们定义在这些质粒进化过程中发生的分子事件,还可以让我们更全面地了解编码在质粒上的大量附属基因。比较质粒序列分析为质粒的进化及其亲缘关系、它们的模块化结构以及插入附属基因的热点的存在提供了依据。
我们的优势
已知质粒的全面验证
获得质粒全部特征
无需参考基因组
丰富的项目经验
全面的分析内容
周期短,有竞争力的价格优势
技术流程
数据分析
原始数据质控
基因组序列拼接与分析
质粒序列挑选
基因组圈图绘制
耐药和致病性分析
个性化分析
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 测序深度 |
Illumina 150PE/250PE | 400~500 bp | 100X |
PacBio SMRT | 2 K | 100X |