病毒是地球上分布较丰富的生物体,通过引起疾病和免疫系统反应对人和动植物产生重大影响。尽管它分布广泛和有着重要影响,但只有不到0.01%的被测序。目前,在病毒性传染病的发病机制和新疗法的发展等方面的研究正在迅速进行。病毒全基因组测序是快速了解病毒突变、毒力变化、病毒型别的有效方法。
通过二代/三代测序平台,获得病毒的全基因组序列信息,利用生物信息分析手段,解析编码信息,并在结构基因组学、比较基因组学层面通过差异分析、同源基因分析、共线性分析、物种进化分析等手段探究病毒的毒力系统、基因组的进化与演变历程等;从而更好地理解病毒的多样性、生态学、适应性和进化,并能够预测由病毒引起的新发传染病。
北京安必奇可提供病毒完成图测序服务,满足您不同程度的研究需求。
我们的优势
二代/三代多平台联合,获得更全面的病毒基因组序列
更多变异检测
可完成大型病毒基因组de novo组装
丰富的项目经验
全面的分析内容
周期短,有竞争力的价格优势
可定制的项目设计
技术流程
数据分析
原始数据质控
基因序列组装
蛋白编码基因预测
基因注释(GO注释、eggNOG注释、KEGG注释、Swiss-Prot注释、TrEMBL注释)
比较基因组分析
共线性分析
进化分析
耐药和致病性分析
个性化分析
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
基因组DNA/cDNA | 10~200 ng | ≥10 ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 测序深度 | 项目周期 |
Illumina 150PE/250PE | 300~500 bp | 100X | 视具体项目情况而定 |
PacBio SMRT | 2 K | 100X | 视具体项目情况而定 |