甲基化DNA免疫共沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing, MeDIP测序),通过5'-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片段,然后对富集的DNA片段进行高通量测序。虽然MeDIP测序生成的DNA甲基化图谱较小分辨率在50-100bp左右,不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态,但是该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,可广泛用于大样本量的疾病研究和分子育种研究。
安必奇生物信息团队的MeDIP技术服务具有成本低、效率高、检测灵敏度高和覆盖度高等优势,通过多年的发展以及多个项目经验的积累,以期为您的MeDIP测序项目提供完整的解决方案。
我们的优势
性价比高:实验周期短、分析信息全,针对感兴趣的区域及相关基因,用于大样本量及高深度研究
高灵敏度:实验对起始DNA量的要求较低,从而使得起始细胞数目的减少,更有利于早期胚胎发育相关的研究
高分辨率:强大的生物信息计算能力,可以将测序得到的序列定位到特定基因组的精确碱基位置上,分辨率高
定制化的MeDIP测序方案:可根据实际需求制定个性化的MeDIP测序方案
技术流程
数据分析
应用领域
表观异质性
环境与表观遗传
基因表达调控
疾病研究
遗传印记
胚胎发育
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
DNA | ≥10ng | ≥1ng/μl | 1.8-2.0 |
技术参数
测序平台 | 测序策略 | 数据量 | 运转周期 |
HiSeq | SE 50 | 20M或40M clean reads | 根据具体项目情况而定 |
询价及订购
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参考文献
Lin C Y, Erkek S, Tong Y, et al. Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins [J]. Nature, 2016.
Hewitt S C, Li L, Grimm S A, et al. Research resource: whole-genome estrogen receptor α binding in mouse uterine tissue revealed by ChIP-seq [J]. Molecular endocrinology, 2012, 26(5): 887-898.
Park P J. ChIP–seq: advantages and challenges of a maturing technology [J]. Nature Reviews Genetics, 2009, 10(10): 669-680.