长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,广泛存在于各种生物体内。lncRNA参与多个生命活动调控过程,其在剂量补偿效应、表观遗传调控、转录以及转录后的调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥着重要的作用,鉴于此,lncRNA近年来已成为遗传学研究热点。
lncRNA测序是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有lncRNA和mRNA,通过lncRNA测序,可以快速获得已知lncRNA和新的lncRNA及其靶标的相关信息,从而促进lncRNA的深入研究。
安必奇lncRNA测序技术服务,结合高通量测序技术以及生物信息学分析,能够一次性获得样本中的lncRNA信息,为您的项目提供完整的解决方案。
我们的优势
一站式的lncRNA测序服务:包括上游的测序以及下游的功能验证服务
高通量、高质量:实验周期短、效率高、成本低、质量可靠
标准化的分析流程:专业的生物信息团队以及分析服务体系,为您提供标准分析、高级分析以及多组学联合分析
丰富的物种以及项目经验:专业的测序技术人员协助设计实验方案、解决实验问题并分析实验结果
定制化的lncRNA测序方案:可根据实际需求制定个性化的lncRNA测序方案
技术流程
数据分析
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
RNA | ≥3 μg | ≥100ng/μl | 1.8-2.2 |
血清血浆 | 20ng | ||
FFPE | 200ng |
技术参数
测序平台 | 测序策略 | 指标 | 运转周期 |
HiSeq 2500 | SE150 | 一般深度:12Gb clean data; 高深度:24Gb clean data | 60个工作日 |
询价及订购
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参考文献
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Zhang Y C, Liao J Y, Li Z Y, et al. Genome-wide screening and functional analysis identify a large number of long noncoding RNAs involved in the sexual reproduction of rice [J]. Genome biology, 2014, 15(12): 1.
Pandey G K, Mitra S, Subhash S, et al. The risk-associated long noncoding RNA NBAT-1 controls neuroblastoma progression by regulating cell proliferation and neuronal differentiation [J]. Cancer cell, 2014, 26(5): 722-737.