De novo测序也叫基因组从头测序，主要针对未知物种的基因组序列，构建不同类型的基因组DNA文库，并进行序列测定。然后通过生物信息学的方法对测序所得到的序列进行拼接、组装和注释，从而获得该物种完整的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术，可以获得动物、植物、细菌、以及真菌的全基因组序列，从而推进该物种的研究。
安必奇的生物信息团队为您提供一站式的基因组de novo测序技术服务，包括从实验设计、样本准备、上机测序到生物信息学分析，旨在为您的基因组学提供解决方案。我们的基因组从头测序技术服务包括：
1. 动植物基因组de novo测序
2. 细菌基因组de novo测序
3. 真菌基因组de novo测序
4. 宏基因组de novo测序
我们的优势
平台优势：获取高质量的基因组图谱
高深度测序：准确率高
丰富的数据分析内容：标准分析、高级分析、定制化分析
丰富的基因组测序及分析经验：已完成多项大型基因组测序项目
定制化的基因组测序方案：可根据实际需求制定个性化的基因组测序方案
技术流程
数据分析
I. 动植物基因组de novo测序数据分析
II. 细菌真菌基因组de novo测序数据分析
提供结果
比对和counts数计算
差异基因表达分析
差异转录本表达分析
发现新型异构体
组装De novo转录组
分析基因GO功能
定制化信息分析
样本要求
| 样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
| 动物组织 | >500mg | ||
| 动物组织 | >500mg | ||
| DNA | >400μg | ≥30ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
| 项目类型 | 测序平台 | 测序策略 | 数据量 | 运转周期 |
| 动植物基因组de novo测序 | HiSeq | PE150 | Contig N50 ≥ 20 kb Scaffold N50 ≥ 300 kb | 视具体项目情况而定 |
| 细菌基因组de novo测序 | HiSeq | PE150 | ≤30 scaffolds | 视具体项目情况而定 |
| 真菌基因组de novo测序 | HiSeq | PE150 | Scaffold N50≥300kb | 视具体项目情况而定 |
询价及订购
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参考文献
Li, Ruiqiang, et al. "De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing." Genome research 20.2 (2010): 265-272.
Huang J, Zhao Y, Shiraigol W, et al. Analysis of horse genomes provides insight into the diversification and adaptive evolution of karyotype [J]. Scientific reports, 2014, 4.
