Small RNA是生命活动重要的调控因子,几乎存在于所有的生物体中,主要包括miRNA、piRNA、siRNA和ncRNA等。Small RNA参与许多重要的生物学过程,在基因表达、生物个体发育、代谢及疾病的发生等过程中起着重要的作用。
Small RNA测序是研究生物样品小RNA的主要方法之一,首先采用胶分离技术,收集样品中18-30nt的RNA片段,再通过高通量测序技术,对样本中所有Small RNA进行测序和表达定量,一次性获得单碱基分辨率的数百万条Small RNA序列信息。
安必奇Small RNA测序技术服务具有平台优、通量高、性价比高等优点,旨在为您的Small RNA测序项目提供完整的解决方案。从材料选取,建库测序到后续的数据分析,都有标准化的操作流程,保证研究成果的高质量。
我们的优势
高分辨率、高精确度:单碱基差异的检测,从几个到数万个拷贝精确计数
高通量、高质量:一次测序得到800万条以上的序列,实验周期短、效率高、成本低、质量可靠
标准化的分析流程:专业的生物信息团队以及分析服务体系,为您提供标准分析、高级分析以及定制化分析
丰富的小RNA测序及分析经验:专业的测序技术人员协助设计实验方案、解决实验问题并分析实验结果
定制化的小RNA测序方案:可根据实际需求制定个性化的小RNA测序方案
技术流程
数据分析
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
RNA | ≥3 μg | ≥200ng/μl | 1.8-2.2 |
血清血浆 | 20ng | ||
FFPE | 200ng |
技术参数
测序平台 | 测序策略 | 指标 | 运转周期 |
HiSeq 2500 | SE50 | 一般深度:6-10M clean reads; 高深度:15-20M clean reads | 45个工作日 |
询价及订购
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参考文献
Joshi T, Elias D, Stenvang J, et al. Integrative analysis of miRNA and gene expression reveals regulatory networks in tamoxifen-resistant breast cancer [J]. Oncotarget, 2016, 7(35): 57239-57253.
Gao S, Yang L, Zeng H Q, et al. A cotton miRNA is involved in regulation of plant response to salt stress [J]. Scientific reports, 2016, 6.
Li A, Liu D, Wu J, et al. mRNA and small RNA transcriptomes reveal insights into dynamic homoeolog regulation of allopolyploid heterosis in nascent hexaploid wheat [J]. The Plant Cell, 2014, 26(5): 1878-1900.