DNA甲基化是在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,这常见于基因的5'-CG-3'序列。DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,在基因表达调控、遗传印记、染色质重塑、细菌宿主防御、胚胎发育以及人类癌症发生等方面中起着重要的作用;获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。
全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是采用重亚硫酸盐处理DNA使其未甲基化修饰的胞嘧啶C转化为尿嘧啶U,通过对处理后的DNA结合Illumina高通量测序平台进行全基因组重测序,并与参考基因组进行比对,在全基因组水平上实现单碱基分辨率,评估单个 C 碱基的甲基化水平,进而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。WGBS被广泛应用于人类疾病与动植物研究中,如细胞分化、组织发育等基础机制研究,以及动植物育种、人类健康与疾病治疗等研究领域。
我们的优势
快速、精准找到差异甲基化区域
检测范围广,实现全基因组水平上甲基化研究
稳定的项目流程
周期短,有竞争力的价格优势
技术流程
数据分析
标准分析
原始数据质控
比对到参考基因组
甲基化位点识别
甲基化水平分布趋势:CpG、CHG、CHH甲基化分布比例;CHG/CHH甲基化C附近9bp的序列分析;染色体水平甲基化密度分布;全基因组甲基化图谱;不同基因组区域/基因原件甲基化分布
多样本甲基化差异分析:聚类分析;GO分析;KEGG分析
高级分析
差异表达基因的甲基化水平
差异表达转座子的甲基化水平
甲基化修饰与表达调控关系
甲基化基因和非甲基化基因的表达分析
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
动物样品 | >500mg | ||
植物样品 | >500mg | ||
基因组DNA | 常规≥3μg 低起始量≥50 ng | ≥20ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 测序深度 | 运转周期 |
Illumina 150PE | 350 bp | 30X | 视具体项目情况而定 |