细菌是生物的主要类群之一,也是所有生物中数量较多的一类,广泛分布于土壤和水中,或与其他生物共生。据估计,人体内及表皮上的细菌细胞总数约是人体细胞总数的十倍,与人类生活息息相关,影响着人类健康。因此明确细菌基因序列是深入研究其表达调控、毒性、代谢等生物功能的基础。
美国太平洋生物科学公司(PacBio)推出的Single Molecule Real-Time sequencing(SMRT),即单分子实时测序,实现了对单个DNA分子的实时监控测序。其具有长读长、无GC偏向和无PCR扩增等优势,有效解决了传统二代测序技术的组装难题,大幅度提升了基因组组装的指标,能够克服细菌基因组GC异常、高度重复的问题,得到细菌完成图,No Gap,No N碱基。
我们的优势
丰富的建库、上机经验
丰富的项目经验
周期短,有竞争力的价格优势
高质量的数据保障
技术流程
数据分析
我们的生物信息团队提供基因组的组装,优化以及完整的基因注释
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
基因组DNA | ≥5 μg | ≥50 ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 测序深度 | 组装指标 |
PacBio SMRT | 20 K | ≥ 60X | 完成图 (1-2 contig,无N碱基) 单碱基错误率<0.01% |