全长转录组测序

全长转录组测序（Iso-Seq）是基于PacBio单分子实时测序技术，凭借超长读长的优势（平均读长10-15Kb），可以轻松跨越从5'末端到3'-Poly A尾的完整转录本，无需打断RNA分子，从而获得高质量全长转录本序列。

通过全长转录组测序能够更精准地得到mRNA全长序列及完整结构信息，可以对新基因及其Iso-form进行更全面的研究，克服了转录本二代测序拼接短、信息不完整的难题；实现对可变剪接、同源异构体、同源基因、等位基因、融合基因等精确分析。主要应用领域有比较转录组学、发育转录组学、环境转录组学、辅助基因组注释、肿瘤疾病研究等。

我们的优势

• 超长读长，全面覆盖无需拼接，获取mRNA全长序列

• 高质量的数据保障

• 精准鉴定更多新基因和新转录本

• 丰富的项目经验

• 全面的分析内容

• 周期短，有竞争力的价格优势

• 可定制的项目设计

技术流程

数据分析

全长无参转录组分析

标准分析：
1. 原始数据处理
2. 全长转录本分析：插入片段质控、转录本分类、聚类与矫正
3. 转录本注释：Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因结构分析：可变剪切分析、SSR分析、CDS分析、LncRNA分析、基因家族分析

高级分析：
1. 参考序列比对
2. 表达水平分析
3. 差异表达分析
4. 差异表达转录本KEGG富集分析
5. 差异表达热图分析
6. 差异表达转录本GO富集分析

全长有参转录组分析

标准分析：
1. 原始数据处理
2. 全长转录本分析：插入片段质控、转录本分类、聚类与矫正、与参考基因组比对
3. 转录本注释：Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因结构分析：转录本结构注释、可变剪切分析、SSR分析、新转录本预测、CDS分析、LncRNA分析、融合基因鉴定

高级分析：
1. 参考序列比对
2. 表达水平分析
3. 差异表达分析
4. 差异表达转录本KEGG富集分析
5. 差异表达热图分析
6. 差异表达转录本GO富集分析
7. 基因表达趋势分析
8. 权重共表达网络分析
9. 样本间差异融合基因比较

样本要求

技术参数