RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。
安必奇的生物信息团队为您提供一站式的RIP-Seq技术服务，从材料选取，建库测序到数据分析，每一步都经过科学缜密的设计，为您深度解析目标RNA种类以及其与蛋白的相互作用，保障高质量的研究成果。
我们的优势
性价比高：实验周期短、分析信息全，价格低
高覆盖度：全转录组的覆盖，可在全转录组范围内对蛋白结合位点进行筛选和鉴定
高灵敏度：每个样本可获得数百万条的序列标签，可发现研究转录组上稀有的蛋白结合位点
高精确率：可获得高水平的信噪比数据，准确区分真实事件与噪音，精确定位蛋白结合位点
定制化的RNA免疫共沉淀测序方案：可根据实际需求制定个性化的RNA免疫共沉淀测序方案
技术流程
采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的RNA片段，再通过高通量测序与数据分析，在全转录组范围内筛选及鉴定目的蛋白的RNA结合位点，并且可以基于多个样品进行差异比较。
数据分析
样本要求
| 样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
| DNA | ≥50ng | ≥30ng/μl | 1.8-2.0 |
技术参数
| 测序平台 | 测序策略 | 数据量 | 运转周期 |
| HiSeq | SE 50 | 20M clean reads | 根据具体项目情况而定 |
询价及订购
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参考文献
Bersani C, Huss M, Giacomello S, et al. Genome-wide identification of Wig-1 mRNA targets by RIP-Seq analysis [J]. Oncotarget, 2016, 7(2): 1895.
Liu N, Dai Q, Zheng G, et al. N6-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate RNA-protein interactions [J]. Nature, 2015, 518(7540): 560-564.
Kanematsu S, Tanimoto K, Suzuki Y, et al. Screening for possible miRNA–mRNA associations in a colon cancer cell line [J]. Gene, 2014, 533(2): 520-531.
