真菌,是真核生物中的一大类群,包括酵母、霉菌等微生物,以及人们熟知的菇类。真菌遍及全世界,在地球生物圈中有着与众不同的进化和生活方式,伴随着人类生活,与人类健康息息相关,有着重要的经济和医学价值。世界上首例抗生素——青霉素就来源于霉菌。真菌的基因组大小约为2.5 M~150 M,复杂程度仅次于动植物,获得真菌全基因组序列,并对其进行结构和功能研究,可以让我们更好的对这些菌株深入研究,更好的了解和利用真菌资源,为人类社会创造更大的价值。
随着测序技术的发展,越来越多的真菌基因组被发表,但大多数基因组都是不完整的,缺乏连续的长片段。现在利用PacBio平台可以很好的解决这个难题,其长读长可以轻松跨越GC含量异常和高重复序列,实现reads覆盖的完整性和均一性,帮您得到更完整的真菌基因组序列。我们可以提供真菌Survey、真菌框架图、真菌精细图三种不同精细程度的真菌基因组测序方案,满足不同的科研需求。
我们的优势
丰富的项目经验
高质量的数据保障
周期短,有竞争力的价格优势
专业的生物信息分析团队
技术流程
数据分析
我们的生物信息团队提供基因组的组装,优化以及完整的基因注释
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
基因组DNA | ≥10 μg | ≥50 ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
产品类型 | 测序平台 | 文库类型 | 测序深度 | 组装指标 |
真菌Survey | Illumina PE150 | 350 bp | ≥100X | 无 |
真菌框架图 | Illumina PE150 | 350 bp | ≥100X | 无 |
真菌精细图 | PacBio SMRT | 20 K | ≥ 60X | Contig N50>2 Mb 单碱基错误率:<0.01% 基因组覆盖度:>98% 基因区覆盖度:>99% |