线粒体是真核生物的重要细胞器,编码与自身功能相关的部分基因,参与生命活动的一些重要过程。人类线粒体DNA(mtDNA)是一个紧凑的双链环状基因组,长约16 kb,其基因组具有结构简单、编码区域高度保守、母系遗传、进化速率快、重组率低、拷贝数高等独特特征。
线粒体在细胞功能中起着重要的作用,不仅提供细胞所需90%以上的能量,还参与细胞凋亡和其他重要的细胞功能。人类mtDNA异质性会导致人类疾病,包括癌症、心脏病、糖尿病、老年痴呆症、帕金森氏症和高血压。
北京安必奇利用二代/三代测序平台,对线粒体基因组进行高通量测序,可获得全长 mtDNA基因组序列,筛选mtDNA变异位点和异质性,并检测到在基于扩增丢失的表观遗传修饰信息,有助于线粒体相关疾病的深层挖掘。
我们的优势
高捕获率和覆盖度
准确度高
丰富的项目经验
全面的分析内容
周期短,有竞争力的价格优势
技术流程
数据分析
原始数据质控
与线粒体参考序列比对
SNP/InDel 检测、注释和统计
异质性检测、注释和统计
基因组圈图绘制
系统进化树构建
个性化分析
样本要求
样本类型 | 总量 | 浓度 | OD260/OD280 |
基因组DNA | 0.4 μg | ≥20 ng/μl | ≥ 1.8 |
技术参数
测序平台 | 文库类型 | 测序深度 |
Illumina 150PE/250PE | 180~300 bp | 100x |
PacBio SMRT | 2 K | 1 G |