蛋白质的磷酸化修饰是生物体内重要的共价修饰方式之一。磷酸化修饰本身所具有的简单、灵活、可逆的特性，以及磷酸基团的供体ATP的易得性，使得磷酸化修饰被真核细胞所选择接受成为一种普遍的调控手段。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程，几乎调节着包括细胞的增殖、发育、分化、细胞骨架调控、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩、新陈代谢及肿瘤发生等生命活动的过程，并且可逆的蛋白质磷酸化是目前所知道的主要的信号转导方式。目前已经知道有许多人类疾病是由于异常的磷酸化修饰所引起，而有些磷酸化修饰却是某种疾病所导致的后果。
技术路线
技术优点
全面性：磷酸化蛋白质组学以整个细胞蛋白为研究对象，研究内容包括了细胞内具有生命功能的蛋白，如细胞增生、细胞分裂和细胞分化等相关蛋白，因而研究更为全面。
可靠性：传统的生物学研究蛋白质磷酸化往往针对特定条件，以两个蛋白或更多蛋白之间的相互作用为出发点，具有局限性，缺乏整体认识。磷酸化蛋白质组学则可检测不同蛋白激酶及磷酸化酶对同一个蛋白磷酸化程度的影响，因而结果具有普遍性和可靠性。
有效性：磷酸化蛋白质组学反映的是细胞内真实发生的事件，在一次试验中考虑了不同变量，克服了生物学中逐步添加变量的缺陷。
探索性：磷酸化蛋白质组学以细胞内蛋白为研究对象，相对于传统的生物学研究以及蛋白质芯片，更易发现未知的新磷酸化位点和磷酸化蛋白质。如果可以联合生物学技术，则可以发现具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。
技术平台
Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™
样品要求
组织样品：动物、微生物组织湿重> 30mg; 植物新鲜组织> 300mg。
细胞样本：细胞量> 107。
体液样本：血清体积> 1500 μL。
蛋白质提取物：蛋白质总量>900μg，并且浓度> 1μg/μL。
